Code : MODE Semestre : M1S1 ECTS : 6

MODE : Modélisation en Biologie des Populations et des Ecosystèmes (UPSud)

Localisation principale : UPSud

Responsable : Kamel Soudani, Prof. UPSud


Objectifs :

1- Formaliser les processus biologiques par l’intermédiaire de différentes approches de modélisation mécaniste, statistique et théorique.

2- Acquérir plus généralement des compétences dans le domaine de la modélisation.

Plan des enseignements :

5 TD de 2H de remise à niveau ,4 cours de 3 H chacun, 2 séances de TD d’initiation à SCILAB, 3 séances (ou plus) d’enseignements intégrés en salle info de 3 H chacune, un projet personnel (équivalent à 10H pour les étudiants) : 47 H

5 TD de remise à niveau avec exemple écologique :

  • Lois de distribution, bases de probabilités.
  • Statistiques descriptives et tests d’hypothèses.
  • Rappels de calcul de dérivés et d’intégrales.
  • Résolutions d’équations différentielles.
  • Calcul matriciel.

4 cours :

  • Introduction à la modélisation
  • Différents types de modèles I : statistiques (modèle linéaire et ANOVA) et probabilistes.
  • Différents types de modèles II : modèles analytiques et simulations
  • Validation des modèles, étude de sensibilité, introduction aux problèmes de spatialisation.

Les exemples pris au cours de ces 4 cours couvriront les trois types d’applications : écosystème (flux de masse et d’énergie), dynamique des populations structurées et non-structurées et génétique des populations.
5 ou 6 séances de TD et d’enseignement intégré avec initiation et programmation d’un modèle sur ordinateur avec SCILAB : exemples de simulation de la photosynthèse d’un couvert végétal, modélisation des systèmes proies-prédateurs et simulation du maintien du polymorphisme génétique.

Enseignants :

- Kamel Soudani : prof UPS
- Nicolas Delpierre : MdC UPS
- Marc Girondot : prof UPS
- Paul Leadley : prof UPS
- Franck Courchamp : DR CNRS

Prérequis : connaissances de base en mathématiques et statistiques

Nombre maximum d’inscrits : 100

Nb d’heures : 60 h


Contrôle des connaissances :

Contrôle de projet personnel et oral, examen écrit.

  • Première session : examen écrit/ soutenance orale/ rapport écrit (1/3 ; 1/3 ; 1/3)
  • Deuxième session : examen écrit
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